БакСкрин и БакРезиста - новый способ быстрого и достоверного выявления возбудителей инфекционно-воспалительной патологии

В медицинском центре «Гармония» доступны два новых ПЦР-теста для выявления условно-патогенных бактерий и определения генов резистентности бактерий к антибиотикам.

БакСкрин – тест для выявления 25 условно-патогенных бактерий (количественно).

БакРезиста – тест для выявления 14 генов резистентности к бета-лактамных и гликопептидным антибиотикам у грамположительных и грамотрицательных бактерий (количественно).

Показания для исследования: инфекционно-воспалительные заболевания любой локализации.

Материал для исследования:

  • Моча
  • Эякулят
  • Секрет простаты
  • Отделяемое урогенитального тракта (уретра, цервикальный канал, влагалище)
  • Отделяемое ЛОР-органов и дыхательных путей
  • Раневое отделяемое
  • Аспираты, транссудаты
  • Соскобы с кожи
  • Фекалии
Важно! Выполнение тестов БакСкрин и БакРезиста возможно из одной пробы биоматериала!


Особенности хранения и транспортировки биоматериала до доставки в лабораторию:

биоматериал может храниться до 24 часов в холодильнике при 2-8 С.

Готовность:до 1-2 рабочих дня.

Стоимость исследования:

БакСкрин – 3200 рублей *

БакРезиста – 1500 рублей*

Комплекс БакСкрин+БакРезиста – 3900 рублей*

Стоимость взятия биоматериала оплачивается отдельно.


Важно! Тесты БакСкрин и БакРезиста могут быть выполнены пациентам по направлению врача из другой клиники. Прием врача в Медицинском центре «Гармония» в этом случае не нужен, достаточно направления в произвольной форме.

Важно! Пробы выделенной ДНК хранятся в лаборатории в течение 3 недель. Возможен заказ дополнительных тестов из материала на хранении.

* Цена актуальна на момент написания статьи

Пример бланка результатов теста БакСкрин

#

#

Формат выдачи результата – количественный в Lg ГЭ/образец


Тест БакСкрин

Актуальность исследования

Проблема 21-го века – инфекционно-воспалительные заболевания, вызванные оппортунистическими (условно-патогенными) микроорганизмами (УПМ), которые в отличие от возбудителей инфекционных болезней, входят в состав нормальной микробиоты организма человека. Многие из них сложно культивировать in vitro, а просто факт обнаружения не является подтверждением этиологической значимости.

УПМ могут вызывать инфекционный процесс при ослаблении иммунной защиты и воздействии определенных факторов. К ним относятся хронические заболевания, травматические состояния, прием некоторых медикаментов, пребывание в стационаре, беременность и роды, преклонный и детский возраст.

УПМ могут вызывать инфекции различной локализации и степени тяжести: от гнойно-воспалительных заболеваний кожи до инфекций мочевыводящих путей, пневмонии, некротического фасциита и менингита. Они также могут быть причиной внебольничных инфекций, например, поражений верхних и нижних дыхательных и мочевыводящих путей, кожи и мягких тканей и т.д. Особенно тяжело такие инфекции могут протекать у пациентов, имеющих различные хронические заболевания (сахарный диабет, муковисцидоз, и другие).

Заболевания, вызванные разными УПМ,схожи по клинике, поэтому точно установить возбудителя без лабораторных исследований невозможно. Дифференциальная диагностика необходима для подбора терапии, в том числе в связи с приобретением УПМ новых свойств, таких так антибиотикорезистентность и способность к адгезии и пленкообразованию.

По предложению Американского общества инфекционных болезней (Infectious Diseases Society of America, IDSA), несколько представителей УПМ выделены в отдельную группу ESKAPE-патогенов — значимых возбудителей нозокомиальных инфекций, способных «избегать» бактерицидного воздействия антибиотиков (Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniaе, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Enterobacter spp.)


Наиболее значимые условно-патогенные микроорганизмы и их роль в патологии

Грамположительные бактерии

Staphylococcus spp.

Особенно опасны для пациентов с ослабленным иммунитетом, хроническими заболеваниями и при длительном пребывании в стационаре. Часто обладают резистентностью к антибиотикам

Staphylococcus aureus

Может приводить к развитию бактериемии, эндокардита, костно-суставных и плевропульмональных инфекций, а также инфекций кожи и мягких тканей. Особо клинически значим для больных с муковисцидозом. ESKAPE патоген

Streptococcus spp.

Могут вызывать различные по локализации и степени тяжести инфекции, включая инвазивные

Streptococcus agalactiae

Может вызывать менингиты, бактериемии у новорожденных; послеродовые инфекции у рожениц

Streptococcus pneumoniae

Один из основных возбудителей пневмоний в мире, поражает пациентов с ослабленным иммунитетом

Streptococcus pyogenes

Вызывает как легкие, так и тяжелые инфекции, включая некротический фасциит, синдром стрептококкового токсического шока и бактериемию

Enterococcus spp.

E. faecium (80–90% от всех выделенных у человека энтерококков) вызывает нозокомиальную инфекцию, часто обладает резистентностью к антибиотикам, ESKAPE патоген. E. faecalis (5–10%) — возбудитель внебольничных инфекций

Грамотрицательные бактерии

Enterobacterales

Включает в себя множество клинически значимых представителей УПМ (Citrobacter spp, E. coli, Klebsiella spp. и др.)

Escherichia coli

Доминирующий возбудитель нозокомиальных инфекций, встречается с множественной резистентностью к антибиотикам

Klebsiella pneumoniae

Часто приводит к инфекционным патологиям и фатальным последствиям у пациентов с иммуносупрессией. ESKAPE-патоген

Klebsiella pneumoniae / Klebsiella oxytoca

Встречаются мультирезистентные к антибиотикам штаммы К. oxytoca

Morganella morganii

Вызывает инфекции послеоперационных ран и мочевыводящих путей. Некоторые штаммы обладают устойчивостью к нескольким антибиотикам. Может вызывать различные инфекционные заболевания с высокой смертностью

Serratia marcescens

Вызывает вспышки нозокомиальных инфекций различной степени тяжести. Некоторые изоляты резистентны к β-лактамазам расширенного спектра или к имипенему

Citrobacter freundii

Часто приобретает множественную лекарственную устойчивость к антибактериальным препаратам

Citrobacter koseri

Часто вызывает инфекционные процессы у новорожденных и у пациентов с ослабленным иммунитетом [

Enterobacter cloacae

Обладает резистентностью к антибиотикам. ESKAPE-патоген

Proteus spp.

P. mirabilis, P. vulgaris вызывают инфекции мочеполового тракта, раневые инфекции и менингит. P. mirabilis обладает множественной лекарственной устойчивостью

Haemophilus spp.

Ряд клинически значимых видов (H. influenzaе, H. parainfluenzae, H. haemolyticus и тд.). H. parainfluenzae может вызывать до 4% внебольничных пневмоний

Haemophilus infl uenzae

Более 90% инвазивных форм инфекции H. influenzae приходится на детей в возрасте до 5 лет, большинство которых составляют дети грудного возраста. Один из основных возбудителей инфекции легких у больных с муковисцидозом

Acinetobacter spp.

Бактерии рода Acinetobacter — частые возбудители тяжелых нозокомиальных инфекций. A. baumannii относится к опасным патогенам с множественной лекарственной устойчивостью, входит в группу особо значимых ESKAPE-патогенов

Achromobacter ruhlandii

Наиболее клинически значимы для больных с муковисцидозом, доминируют в российской популяции

Achromobacter xylosoxidans

Burkholderia spp.

Клинически значимы для больных с муковисцидозом

Pseudomonas aeruginosa

Клинически значим для больных с муковисцидозом. ESKAPE-патоген

Stenotrophomonas maltophilia

Часто обладает множественной лекарственной устойчивостью. Клинически значим для больных с муковисцидозом

Диагностика оппортунистических бактериальных инфекций

Для диагностики бактериальных инфекций используются микроскопические, культуральные, серологические и молекулярно-генетические методы.

  • Световая микроскопия мазков, окрашенных по Граму, позволяет сделать вывод о характере микрофлоры и о соотношениях ее компонентов.
  • Бактериологический посев используют для выделения чистых культур микроорганизмов и определения их видовой принадлежности. В сочетании с этим методом возможно определение чувствительности бактерий к антибиотикам.
  • Серологические методы позволяют обнаружить антитела или антигены в крови пациента. Однако у этого метода есть ряд ограничений: он проводится через несколько дней после начала болезни, а также не отличается высокой специфичностью (могут наблюдаться перекрестные реакции с антителами против других возбудителей).
  • Молекулярно-биологические методы предназначены для обнаружения специфических фрагментов микроорганизма и идентификации возбудителя. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) в режиме реального времени — это высокочувствительный метод, который позволяет быстро получить результат.


Тест БакСкрин – 25 условно-патогенных бактерий количественно методом ПЦР в реальном времени

Спектр выявляемых показателей:


  • Общая бактериальная масса (ОБМ)
  • Грамположительные
    • Streptococcus spp.,
    • Streptococcus pyogenes,
    • Streptococcus pneumoniae,
    • Streptococcus agalactiae,
    • Staphylococcus spp.,
    • Staphylococcus aureus,
    • Enterococcus spp.
  • Грамотрицательные
    • Enterobacterales,
    • Escherichia coli,
    • Citrobacter freundii,
    • Citrobacter koseri,
    • Klebsiella pneumoniae/Klebsiella oxytoca,
    • Klebsiella pneumoniae,
    • Enterobacter cloaca,
    • Serratia marcescens,
    • Proteus spp.,
    • Morganella morganii,
    • Pseudomonas aeruginosa,
    • Haemophilus spp.,
    • Haemophilus influenzaе,
    • Burkholderia spp.,
    • Acinetobacter spp.,
    • Stenotrophomonas maltophilia,
    • Achromobacter ruhlandii,
    • Achromobacter xylosoxidans

Преимущества ПЦР-диагностики по сравнению с другими методами исследования

  • Быстро – получение результатов в течение 1-2 рабочих дней
  • Надежно - высокая чувствительность и специфичность
  • Комплексно - выявление всех, в том числе трудно культивируемых микроорганизмов
  • Точно - идентификация микроорганизмов до заданного таксономического порядка
  • Универсально - Исследование широкого спектра биоматериала
  • Быстро – получение результатов в течение 1-2 рабочих дней
  • Надежно - высокая чувствительность и специфичность
  • Комплексно - выявление резистентности у всех, в том числе трудно культивируемых микроорганизмов
  • Точно – выявляет все устойчивые бактерии, в том числе с «молчащими генами», которые не определяются фенотипически
  • Универсально - Исследование широкого спектра биоматериала


Правила подготовки пациента к исследованию, условия отбора и хранения исследуемого биоматериала

Вид биоматериала

Подготовка

Хранение

Моча

  • Утренняя первая порция мочи в количестве 20-30 мл в стерильный одноразовый контейнер.
  • При острой инфекции мочевыводящих путей возможен сбор мочи в течение дня
  • Утренняя первая порция мочив количестве 20-30 мл в стерильный одноразовый контейнер.
  • При острой инфекции мочевыводящих путей возможен сбор мочи в течение дня

При 2-8 С (холодильник) до 24 часов

Секрет простаты

Отбирает врач уролог на приеме

При 2-8 С (холодильник) до 24 часов

Эякулят

Воздержание от половых контактов 3-4 дней, сбор в стерильный одноразовый контейнер путем мастербации (после туалета наружных половых органов и мочеиспускания)

При 2-8 С (холодильник) до 24 часов

Фекалии

Для анализа собирают пробумассой (объёмом) примерно 1–3 г (1–3 мл в специальный стерильный сухой флакон

При 2-8 С (холодильник) до 48 часов

Мазки\соскобы из дыхательных путей

Отбирает медицинская сестра или врач.

При 2-8 С (холодильник) до 24 часов

Мазки\соскобы из урогенитального тракта у женщин (цервикальный канал, влагалище)

  • Отбирает медицинская сестра или врач
  • Подготовка – воздержание от половых контактов 48 часов
  • Отбирает медицинская сестра или врач
  • Подготовка – воздержание от половых контактов 48 часов
  • Воздержание от мочеиспускания 3-4 часа
  • Отбирает медицинская сестра или врач
  • Подготовка – воздержание от половых контактов 48 часов
  • Отбирает медицинская сестра или врач
  • Подготовка – воздержание от половых контактов 48 часов
  • Воздержание от мочеиспускания 3-4 часа

При 2-8 С (холодильник) до 24 часов

Мазки\соскобы из урогенитального тракта у мужчин(уретра)

При 2-8 С (холодильник) до 24 часов

Раневое отделяемое

Отбирает медицинская сестра или врач

При 2-8 С (холодильник) до 24 часов

Экссудаты, транссудаты

Отбирает медицинская сестра или врач

При 2-8 С (холодильник) до 24 часов


Тест БакРезиста

Актуальность исследования

Серьезная проблема, с которой столкнулось человечество в борьбе с инфекционными агентами – это устойчивость к антибактериальным препаратам. Мы все понимаем, что антибиотики спасают жизни и необходимы для борьбы с инфекционными заболеваниями. Именно по этой причине середина 20-го века, когда были созданы первые антибиотики, стала поистине золотой эрой антибиотикотерапии.Благодаря антибиотикам и вакцинам кардинально изменилась структура смертности и существенно выросла продолжительность жизни.

Однако на появление каждого нового антибиотика микробный мир отвечает появлением резистентных штаммов, а гены резистентности сохраняются в геноме бактерий. Так метициллин резистентный штамм стафилококка (MRSA) был впервые зарегистрирован всего через 2 года после создания метициллина.

В последние десятилетия распространенность штаммов микроорганизмов, устойчивых к антибактериальным препаратам (АБП), значительно затрудняет лечение пациентов с бактериальными инфекциями. Устойчивость к АБП препятствует эффективной терапии и способствует появлению хронических и рецидивирующих инфекций. Заболевания, вызванные антибиотикорезистентными штаммами, отличаются длительным течением, часто продолжительным пребыванием в стационаре и неблагоприятным прогнозом для пациентов.

Резистентность микроорганизмов может быть природной и приобретенной, но ее формирование во всех случаях обусловлено генетически. При этом гены устойчивостизачастую локализованы на мобильных генетических элементах и способны к быстрому распространению как внутри одного вида, так и между разными видами бактерий. Интенсификации этого процесса способствуют избыточное и необоснованное назначение антибактериальных препаратов; самолечение, сопровождающееся недостаточностью знаний об этиологии инфекционного процесса, спектре действия антибиотиков; использование АБП для лечения и стимуляции роста животных и птиц в сельском хозяйстве.

Наиболее значимые гены резистентности к бета-лактамным и гликопептидным антибиотикам у грамположительных и грамотрицательных бактерий

Ген резистентности

Бактерии, у которых данный ген может присутствовать

Антибиотики

van A/B

грамположительные

ванкомицин, тейкоплакин

mec A

грамположительные

метициллин, оксациллин

tem

грамотрицательные

пенициллины и цефалоспорины

ctx-M-1

грамотрицательные

shv

грамотрицательные

oxa-40-like

грамотрицательные

карбапенемы

oxa-48-like

грамотрицательные

oxa-23-like

грамотрицательные

oxa-51-like

грамотрицательные

imp

грамотрицательные

kpc

грамотрицательные

ges

грамотрицательные

ndm

грамотрицательные

vim

грамотрицательные


Методы определения антибиотикорезистентности у бактерий

Для выявления резистентности к АБП применяют фенотипические (микробиологические) и молекулярно-генетические методы, в том числе полимеразную цепную реакцию (ПЦР).

Результаты, полученные с применением ПЦР, коррелируют с диско-диффузионным методом и методом серийных разведений. При этом ПЦР-исследование не требует манипуляции с живыми бактериальными культурами, что предотвращает распространение и циркуляцию микроорганизмов внутри лечебно-диагностических и лабораторных учреждений. ПЦР-диагностика позволяет значительно ускорить получение результатов — это особенно важно для лечения тяжелых инфекций, поскольку эффект этиотропной терапии во многом зависит от времени назначения подходящих антибиотиков

Определение генов резистентности к антибиотикам — важная дополнительная клиническая информация для врача при подборе эффективной терапии, она не может быть получена микробиологическим методом определения чувствительности.

ПЦР-диагностика — прямой метод, который позволяет проводить определение генов антибиотикорезистентности у труднокультивируемых микроорганизмов. На результат ПЦР-исследования не влияют режимы хранения антибактериальных препаратов и питательных сред.

Преимущества ПЦР-диагностики по сравнению с другими методами исследования

Правила подготовки пациента к исследованию, условияотбора и хранения исследуемого биоматериала

Вид биоматериала

Подготовка

Хранение

Моча

При 2-8 С (холодильник) до 24 часов

Секрет простаты

Отбирает врач уролог на приеме

При 2-8 С (холодильник) до 24 часов

Эякулят

Воздержание от половых контактов 3-4 дней, сбор в стерильный одноразовый контейнер путем мастербации (после туалета наружных половых органов и мочеиспускания)

При 2-8 С (холодильник) до 24 часов

Фекалии

Для анализа собирают пробумассой (объёмом) примерно 1–3 г (1–3 мл в специальный стерильный сухой флакон

При 2-8 С (холодильник) до 48 часов

Мазки\соскобы из дыхательных путей

Отбирает медицинская сестра или врач.

При 2-8 С (холодильник) до 24 часов

Мазки\соскобы из урогенитального тракта у женщин (цервикальный канал, влагалище)

При 2-8 С (холодильник) до 24 часов

Мазки\соскобы из урогенитального тракта у мужчин(уретра)

При 2-8 С (холодильник) до 24 часов

Раневое отделяемое

Отбирает медицинская сестра или врач

При 2-8 С (холодильник) до 24 часов

Экссудаты, транссудаты

Отбирает медицинская сестра или врач

При 2-8 С (холодильник) до 24 часов


Загрузка беседы